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空间代谢组学基本参数
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  • 欧易生物
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  • 上海欧易生物科技有限公司
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空间代谢组学企业商机

空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合(图1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达,但不降低MYC基因的表达。其次,ChIP的MYC与启动子结合,不仅调节FA合成基因的表达,还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此,MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因:首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺,然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序(RNA-seq)发现,增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。空间代谢组学基于AFADESI-MSI的代谢物研究。四川空间代谢组学基本研究流程

如空间代谢组。研究中开发了一种新的基于拉曼光谱和空间代谢组学分析的脂质组学(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通过特定髓鞘蛋白的免疫标记进行了验证。利用拉曼和空间代谢组学数据生成了分子成像图谱,用于体外组织的生物分子结构和组成的关联。将相关脂质组成像方法应用于局灶性脱髓鞘小鼠模型和多发性硬化症死后脑标本的髓鞘再分化研究。发现不仅在脱髓鞘脑组织和正常脑组织之间,在有髓鞘组织和正常有髓组织之间,脂质成分皆存在差异。四川空间代谢组学基本研究流程什么是空间代谢组学?。

作者进行了空间代谢组学(∼50μm的空间分辨率),并根据m/z848.63和m/z844.52对主要的髓鞘标志物进行了成像,推测它们分别属于Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(图2G)。白质和灰质的代表性质谱如图2H所示。结果表明,使用拉曼光谱结构信息和空间代谢组学对髓鞘中的脂质进行特定的成分分析是可能的。对单个有髓组织成分光谱的分析证实,构成有髓组织光谱的主要分子是脂质,包括脑苷脂、胆固醇、鞘磷脂、磷脂酰胆碱,以及程度较小的蛋白质(图2F)。

展示了空间代谢组成像技术的应用。这一分析***表明脱髓鞘后新形成的髓鞘具有与正常髓鞘不同的脂质成分。因此,这种HSL方法学可能**提高目前对多发性硬化症再髓鞘形成的理解,并可能为多发性硬化症研究中评估再髓鞘形成***提供一种新的策略。此外,HSL方法可以针对***的组织量身定做,为生物医学科学中的脂质结构和成分提供至关重要的见解。该研究开发了一种基于拉曼光谱、解吸电喷雾电离质谱(空间代谢组学)和免疫荧光成像的相关脂质组成像(HSL)方法,研究多发性硬化症病变中的再髓鞘形成与正常髓鞘不同的脂质成分。结果通过对脂质结构和成分的研究为再髓鞘化***提供可能性。空间代谢组分析测序服务。

结果表明,原*基因MYC与SERBP蛋白共同调节**生长所必需的脂肪生成,MYC诱导SREBP1,然后二者共同***脂肪酸合成并利用葡萄糖和谷氨酰胺促进脂肪链的延伸。小鹿推荐通过空间代谢组学技术,能够观察到MYC诱导后不同**的体内脂质组学变化,准确地绘制MYC特异性脂质代谢的位置,因此可以利用这一**的致命弱点,用于新的抗脂质药物研究开发。在获得空间代谢组学AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析,检测物质涵盖胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物。空间代谢组学研究应用前景广阔。四川空间代谢组学基本研究流程

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鹿明生物AFADESI-MSI空间代谢组技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。具有免标记、无需基质、周期短、定位准的特点。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下,经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累,鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析,积累了丰富的样本前处理经验。四川空间代谢组学基本研究流程

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