浙江 LV载体拷贝数分析

质粒的不相容性通俗来说，就是一山不能容二虎。但是作为科学来说，我们需要一个严谨的定义。“利用同一复制系统的两个质粒会在复制和随后向自细胞的分配过程中彼此竞争，这样的质粒在细菌培养物中不能和平共处，这种现象称之为不相容性”。那要怎么才能在一个菌里面使用两个质粒呢？简单的方法就是使用不同复制源的且带有不同抗性基因的两个质粒。pUCori：复制起始点，pUC为高拷贝表达质粒（120-200个/细胞）。Amp：氨苄抗性，为原核抗性，用于质粒抽提时的筛选。U6promoter：U6启动子，真核启动子，启动shRNA的表达。CMV：真核启动子，启动ZsGreen1的表达。ZsGreen1：第三代绿色荧光蛋白，亮度比较高的的荧光蛋白。PGK：真核启动子，启动Puro的表达。Puro：嘌呤霉素抗性基因，真核抗性，用于质粒或病毒进入细胞后的筛选。Amp：氨苄抗性基因，原核抗性，用于质粒抽提时的筛选。WPRE：转录后调控序列，增加外源片段的表达效率。3’LTR、5LTR：逆转录病毒基因组两端各有一个长末端重复序列(5—LTR和3—LTR)，不编码蛋白质，含有启动子，增强子等调控元件。基因拷贝数是指:某一种基因或某一段特定的DNA序列在单倍体基因组中出现的数目。浙江 LV载体拷贝数分析

拷贝数，是指某基因（可以是质粒）在某一生物的基因组中的个数。单拷贝就是该基因在该生物基因组中只有一个，多拷贝则指有多个。在细菌细胞中，根据复制特性，质粒分严紧型和松弛型两类，前者在细胞中只含1〜2个，而后者含10〜15个以上。恒定的拷贝数与质粒复制控制系统、宿主细胞遗传背景及生长条件有关。拷贝数变异(Copynumbervariation,CNV)是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复。武汉上市后载体拷贝数CRO质粒拷贝数分为严谨型与松驰型。

在基因工程中，质粒的拷贝数应该怎么理解?为什么构建载体时要选择高拷贝数的质粒载体?把细胞当做工厂，质粒就是厂房里的流水线，拷贝数就流水线的数量在理想状态下，选择尽量多的流水线，这样能得到的产品多，这是很自然的选择实际上，高拷贝也有它的问题，当流水线多到一定程度，决定产量就不只是流水线的多寡，工人的工作效率，也就是转录翻译水平，也会影响到较终的产量此外，过多的流水线带来放不下的情况，工厂没那么大地方，原材料供应不上，吃不消，也会影响到工厂正常运转所以，拷贝数只是一个方面，构建载体要综合考虑各方面及实际用途。有时低拷贝质粒渗漏表达，反而有奇效。

数字PCR（DigitalPCR），数字PCR的基本原理是将含有核酸分子的反应体系分成成千上万个纳升级的微滴，其中每个微滴或不含待检核酸靶分子，或者含有一个至数个待检核酸靶分子，且每个微滴都作为一个duli的PCR反应器。经PCR扩增后，采用微滴分析仪逐个对每个微滴进行检测，有荧光信号的微滴判读为1，没有荧光信号的微滴判读为0（因此该技术被称为“数字PCR”），较终根据泊松分布原理以及阳性微滴的比例，分析软件可计算给出待检靶分子的浓度或拷贝数（无需标准曲线的绘制）。载体拷贝数评估结构，欢迎来电咨询上海唯可！

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