反转录酶的注意事项,引物的选择,OligodT:选择OligodT时,要求RNA必须有PolyA,所以真核生物的mRNA都适用。适合长链甚至全长mRNA的RT,所以对RNA样品的质量要求较高,较好不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。假如想探索新的mRNA进行RT反应,建议推荐使用OligodT引物。使用OligodT引物要比随机引物和特异性引物的稳定性要好。特异性引物:特异性引物只能用你设计引物时的下游引物做RT,引物设计质量影响RT的结果,而且不同引物退火温度本来就不相同,所以按照说明书按照一个温度做不是较佳选择,一般不推荐。逆转录技术可以进行从RNA到DNA的转化,从而保护RNA序列的完整性。彩色逆转录混合蛋白质提取
逆转录(reversetranscription)是以RNA为模板合成DNA的过程,即RNA指导下的DNA合成。此过程中,核酸合成与转录(DNA到RNA)过程与遗传信息的流动方向(RNA到DNA)相反,故称为逆转录。逆转录与反转录严格意义上来说没有什么区别,但是逆转录是某些病毒的自主行为,如逆转录病毒,它们在整合到宿主细胞内前以RNA为模板形成DNA的过程;反转录是进行基因工程过程中,人为地提取出所需要的目的基因的信使RNA,并以之为模板人工合成DNA的过程。二者虽同为RNA→DNA的过程,但地点不同,相对性的来说,逆转录在体内,反转录在体外。彩色逆转录混合蛋白质提取逆转录是许多病毒复制中必不可少的步骤。
逆转录实验步骤:用SSⅢ逆转录酶进行RT(20ul体积)1、准备0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暂离心。3、65℃水浴5分钟后,立刻0℃冰水浴至少1分钟。4、短暂离心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆转录酶。5、短暂离心。6、50℃水浴60分钟进行逆转录。7、70℃水浴15分钟灭活逆转录酶。8、-20℃保存,或立即进行PCR。MCERTmix含有比例优化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可从RNA转录本的各个区域起始,并具有相同的逆转录效率,较大程度保证qPCR结果的真实性和可重复性。
反转录酶(reversetranscriptase,也可写成逆转录酶)又称为依赖RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中发现了一种特殊的DNA聚合酶,该酶以RNA为模板,以dNTP为底物,tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物,在tRNA3'-OH末端上,根据碱基配对的原则,按5'-3'方向合成一条与RNA模板互补的DNA单链,这条DNA单链叫做互补DNA(complementaryDNA,CDNA)。反转录酶(Reversetranscriptase)是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。逆转录的反应机理是RNA模板上的DNA合成。
逆转录试剂的应用:近年来,随着基因编辑技术和基因疗法的快速发展,逆转录试剂的应用范围也在不断扩展。例如,在CRISPR-Cas9系统中,逆转录试剂可以用来进行sgRNA的合成和优化,从而提高基因编辑的效率和精度。此外,逆转录试剂还可以用来合成DNA的反义链,从而为基因疗法的开发提供技术支持。总之,逆转录试剂是一类重要的生物学试剂,它们可以促进逆转录反应的进行并在多个领域中发挥着重要的作用。在未来的研究中,逆转录试剂的应用范围将会不断扩展,并且将为生物医学研究和治着提供更多的支持。逆转录现象说明:至少在某些生物中,RNA同样兼有遗传信息传递和表达功能。彩色逆转录混合蛋白质提取
高效的逆转录体系可提高反应效率和检测灵敏度。彩色逆转录混合蛋白质提取
逆转录的过程:生物体中的逆转录过程就比较复杂,比如逆转录病毒(retrovirus)。病毒是真正的“极简风”,所有东西都压缩到非常。比如它的基因组中,经常有些基因是重叠、嵌套结构,充分利用每一个碱基。所以它也不会专门编码一个引发酶来合成引物,它一般是在组装时带走宿主的tRNA,在下次侵染时当作引物使用。被用作引物的tRNA会结合在病毒基因组RNA链的中间,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因组RNA两端的一段重复序列,“跳”回另一端,完成整条链的逆转录。之后水解RNA链的时候,会留下一些片段作为复制的引物。双链DNA的合成同样也需要经过一次跳跃(jump),以合成完整双链。较后两端具有相同的序列,称为长末端重复(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳跃时用来配对的序列,还有整合信号、启动子、增强子、polyA位点等重要结构。彩色逆转录混合蛋白质提取