关于BD Rhapsody单细胞平台的样本类型和样本制备 :在上机前需要注意细胞消化后的细胞团块,获得分离良好的细胞悬液、且细胞活力高(>70%);此外,了解您所研究细胞的大小范围也很重要。细胞大小通常与细胞表达的转录本数量有关。各种尺寸不同的细胞(一般直径不大于50μm)均可与我们基因表达解决方案中使用的BD Rhapsody平台兼容。一般来说,细胞制备方案将根据组织来源和细胞类型而变化。每种组织类型都是独特的,因此,必须在开始任何单细胞实验之前优化样本制备,烈冰多年样本解离消化经验,累积10+物种、50+组织的消化protocol,若您的样本为组织,且尚未成功将组织样本消化成单细胞悬液,烈冰将尽可能提供技术及实验上的帮助。烈冰一站式单细胞测序服务:立足科学研究,解码生命本质。苏州BD Rhapsody单细胞平台
烈冰生物为您的实验定制工作流程: 对于不同用户和实验,单细胞实验工作流程往往需要不同程度的样本操作、质量和通量。BD仪器选项可以根据具体需求进行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分选平台(如 BD FACSMelody),是上游样本富集的良好选择。此外,我们具备BD Rhapsody单细胞成像仪提供自动化细胞计数和细胞样本活性测试,帮助用户制备适用于Cartridge微孔板单细胞捕获浓度的样本。扫描仪提供了微孔板上磁珠捕获细胞的计数。BD Rhapsody 样品上样工作站轻巧便携,可在实验室内轻松移动。搭配烈冰倾情研发多年的成果NovelBrain生物信息大数据分析系统,完成测序数据的生物信息分析和结果可视化呈现。这些工具包括 UMI 分析算法和可视化工具,即使没有经验的用户也可分析和理解单细胞数据。济南BD单细胞多组学测序单细胞测序是高通量测序下的又一重大技术突破。
根据烈冰多年单细胞测序服务经验,为什么不建议您一味的追求高细胞数量的捕获:单细胞测序所有的分析都是基于细胞聚类进行,而细胞聚类是在区分cell和non-cell后,获得细胞基因表达谱,通过降维(pca),无监督聚类以及可视化(t-SNE)得到的。进行细胞聚类时需要考虑到每个细胞的基因表达模式,因此即使是相同的数据,在剔除几个细胞的情况下,前后获得的聚类图也会出现明显不同。而当细胞捕获数过多时,无论是假阴性和假阳性数据还是多细胞数据,都会对正常细胞聚类产生影响,造成聚类结果失真。这也是很多文章,特别是很多高分文章,为什么单个样本捕获细胞数在2000-3000的原因了。烈冰建议单个样本捕获细胞数在3000-5000个时,数据量在100G左右时,可以满足分析和文章发表的多重需求。
烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深度解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!此外,烈冰生信团队根据丰富的实战经验为用户量身打造了一款单细胞测序结果解读的神兵利器——单细胞浏览器(Single Cell Browser),不但可以将海量复杂的结果文件可视化,还是可以实现三维立体化展示的软件。专业的生信代码交给专业的烈冰,专业的生物学意义交给专业的您,详情请咨询烈冰生物。截至2022年6月,烈冰助力发表单细胞测序文章30+篇。
基因和基因产物并不是单独运作的,而是参与了相互关联的复杂通路、网络和分子系统,这些合在一起实现了细胞、组织和生物体的运作。定义这些系统并确定它们的特征和相互作用,对于了解生物系统如何运作至关重要。”为了推动科学发现,科学家们需要各种能够帮助多方位了解其样本的潜在生物复杂性的研究工具。对于越来越多的研究人员来说,单细胞RNA测序和单细胞多组学——即在单细胞分辨率下对基因表达及其他基于DNA、RNA或蛋白质的分析物进行定量分析的基因组方法——在帮助解决他们面临的生物学问题上已证实是行之有效的。2019年,烈冰已助力发表了采用BD Rahpsody平台的单细胞风湿类文章。上海BD单细胞测序服务公司
烈冰专注单细胞多组学测序领域。苏州BD Rhapsody单细胞平台
单细胞获得困难,不同组织要求不尽相同难以搞定? 烈冰2000+项目消化经验,100+组织类型解离protocol,精心设计不同组织实验的解离、细胞悬浮实验体系,确保单细胞的获得。 冻存样本无法实验,珍贵样本无法使用? 烈冰采用国际认可的冻存组织复苏技术以及死细胞过滤技术,确保冻存组织使用。 珍贵样本,细胞数量太少,消化背景杂无法做单细胞? 采用国际认可的10X Genomics,BD Rhapsody双平台模式,根据样本实际情况和用户需求提供客观有效的实验方案,细胞量少,背景杂也能做单细胞。 单细胞RNA分类精度不足,部分细胞无法细分? 烈冰同时采用单细胞蛋白质组与单细胞转录组测序技术,真正做到从上游到下游的全流程检测,确保超高的细胞分类精度。苏州BD Rhapsody单细胞平台
上海烈冰生物医药科技有限公司发展规模团队不断壮大,现有一支专业技术团队,各种专业设备齐全。专业的团队大多数员工都有多年工作经验,熟悉行业专业知识技能,致力于发展NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造的品牌。我公司拥有强大的技术实力,多年来一直专注于生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】的发展和创新,打造高指标产品和服务。诚实、守信是对企业的经营要求,也是我们做人的基本准则。公司致力于打造***的单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。