上海代谢组学和肠道菌群相关分析

GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，2021年11月，上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果，通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，发现了BPF暴露的肠道毒性的特征，探究了可能的发病机理。中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象：人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影响因子：7.963发表时间：2021年11月合作单位：上海交通大学附属新华医院运用生物技术：GC-MS非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组学、qRT-PCR**话代谢、代谢组学实验设计、数据解读分析、数据库介绍及使用流程。上海代谢组学和肠道菌群相关分析

非靶向代谢组学研究：对于代谢物分析，作者对非靶代谢组学测定，共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性（VIP）>1和p<0.05的筛选标准，在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物（DAM）（表1）。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段，发现S3的DAM比S1和S2更丰富，这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后，利用京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中，参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大，包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯酸”。北京代谢组学 培训代谢组学 寻找代谢物与生理病理的研究方式。

代谢组学研究：浓香型白酒（SFB）在窖泥窖内发酵过程中，获得了其特有的风味。窖泥中的微生物是产生风味酯的关键前提物。本篇为欧易/鹿明生物合作客户四川省农业科学院水稻高粱研究所（一作：刘茂柯）于2020年3月在微生物学专刊《mSystems》（IF=6.469）发表的题为“Structural and Functional Changes in Prokaryotic Communities in Artificial Pit Mud during Chinese Baijiu Production”的研究报道，该研究对酿造微生态系统进行了***16S rRNA测序，蛋白质组学和代谢组学联合分析。运用多组学方法能够更***地了解高质量浓香白酒生产过程中人工窖泥微生物群落发生的代谢过程变化，这将有助于进一步优化人工窖泥培养技术和改善浓香白酒的质量。

代谢组学+转录组学，中文标题：基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象：斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊：JournalofHazardousMaterials影响因子：10.588运用生物技术：代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展，作者：杨桂玲，王彦华，李健，王豆，鲍志伟，王强（通讯作者），靳远详（共同通讯作者），在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章，通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。研究认为获得的数据可以为不同类型杀菌剂及其混合物对水生生物的毒性提供理论依据。代谢组学-鹿明生物-欧易生物 以生物体内所有代谢产物为研究对象。

代谢组学等多组学研究，2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文，通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*（iCCA）患者的配对**和*旁组织进行了分析，通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。代谢组学方案改变科学的组学研究方案,即刻咨询!。江苏代谢组学概述

代谢组学专区 系统生物学驱动的功能代谢组学方法,具有高灵敏、高分辨和高通量。上海代谢组学和肠道菌群相关分析

GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究：盐度的变化会影响甲壳类动物的生长、***和疾病状态。文章作者通过非靶代谢组学对青蟹适应盐度急性下降过程中的代谢变化进行了研究，利用GC-MS和LC-MS数据联合分析了青蟹应对盐度急性下降情况的主要代谢途径。研究结果表明，在急性低盐胁迫下，青蟹通过甘油磷脂代谢物调节生物膜的结构发生变化，然后通过ABCs转运蛋白运输氨基酸和碳水化合物，实现细胞内外的渗透平衡。此项研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。王春琳课题组深耕青蟹研究，近些年来探索青蟹对环境的适应变化也在各大期刊上发表：项目文章|iTRAQ蛋白组学助力宁波大学越冬期间拟穴青蟹代谢变化研究项目文章|两篇背靠背，王春琳、王欢课题组揭示拟穴青蟹适应盐度骤降的代谢机理上海代谢组学和肠道菌群相关分析

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