非靶向代谢组学研究:通过在三个成熟阶段收获两个东方甜瓜品种的果实作者使用非靶代谢组学联合转录组学发现可溶性糖和有机酸在转录组水平和代谢组水平的差异现象。这项研究运用多组学技术联合揭示了两个品种成熟过程中关键的代谢和转录特征。在本研究中,通过代谢和转录组分析的综合分析,研究了控制两个东方甜瓜品种'甜宝'和'小翠瓜'中糖和有机酸代谢的基因网络。筛选了与糖和有机酸代谢相关的关键代谢物和候选基因,并讨论了甜瓜品种甜度不同的可能解释。研究结果提高了对决定甜瓜发育和成熟过程中糖和有机酸积累和代谢的分子机制的理解。代谢组学-欧易生物/鹿明生物 客户好评 专注代谢组学研究。江苏功能代谢组学
双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中国医学科学院医药生物技术研究所李亮课题组在Environmental Pollution期刊发表了题为“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通过LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法,发现了空气中颗粒物和生物气溶胶暴露有关的尿液生物标志物,并揭示了循环暴露于清洁和污染空气环境的年轻健康人的尿液代谢特征的动态变化。鹿明生物技术支持及生信分析同事为该文章做出相应贡献,为署名作者。浙江代谢组学液质联用代谢组学专业第三方检测,出具报告快,数据准。
LC-MS靶向代谢组学研究本篇文章通过LC-MS靶向代谢组学和16S rRNA基因序列分析,探究谷物在加工传统饮料ogi过程中******的减少和细菌群落的动态变化。同时,从粮食安全方面考虑,谷物的污染水平低、较安全,又优于玉米,可以代替受******污染的玉米品种。欧易/鹿明生物推出的16s+代谢组学的多层组学研究思路继本篇文章前已先后助力了浙江工业大学、中国农科院、青岛农业大学等在微生物一区顶刊Microbiome、医学一区顶刊GUT发表文章。项目文章PBP | 浙江工业大学傅正伟运用GC-MS非靶向代谢组学和16S探究水稻根际微生物群落影响项目文章 | 恭喜中国农科院及青岛农业大学团队继GUT后又喜发微生物顶刊Microbiome。
非靶向代谢组学研究:对于代谢物分析,作者对非靶代谢组学测定,共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性(VIP)>1和p<0.05的筛选标准,在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物(DAM)(表1)。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段,发现S3的DAM比S1和S2更丰富,这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后,利用京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中,参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大,包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯酸”。非靶向代谢组学,靶向代谢组学研究经验。
土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化,使用基于GC-MS的非靶向代谢组学,在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量,定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5,在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物(图3I),除少数几个代谢物上调,大多数代谢物减少,表明AgNPs暴露通常会对土壤微生物的代谢产生负面影响。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应,包括毒性机制和***策略。读懂代谢组学 代谢组学的研究范畴。江苏肠道微生物 代谢组学
代谢组学-方法与应用-实验操作-仪器设备。江苏功能代谢组学
微生物16S rRNA测序+代谢组学研究:标题:EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠粪便、脑组织*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍(ASD)是一种发育障碍,目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明,肠道菌群与ASD发展之间存在联系,但肠道菌群与ASD的脑功能障碍(肠脑轴)联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因(位于7q号染色体,属于受体酪氨酸激酶Eph家族),因基因突变和在ASD患者中表达下调,被认为是ASD的候选基因。但尚不清楚EphB6在调节肠道菌群和ASD发生的作用机制。本研究中作者发现EphB6在功能上与ASD相关,并通过肠道菌群介导的维生素B6和多巴胺,调节患者自闭症样行为。作者建立了EphB6缺陷小鼠肠道菌群失调与内侧前额叶皮层(mPFC)(关键的肠脑功能轴)的兴奋/抑制失衡之间的功能联系。江苏功能代谢组学
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