上海代谢组学

代谢组学经典研究：本篇小鹿将为各位看官推荐4篇使用代谢组学的经典研究，***篇文章运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学探究番茄果实成熟过程中的代谢变化。第二篇文章运用16S rRNA测序+代谢组学技术研究不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。第三篇文章运用GC-MS顶空代谢组学探究新等位基因系和野生型的成熟种子中发现了几种不同的挥发性化合物。第四篇文章运用GC-MS非靶向代谢组学技术对对全氟辛酸（PFOA）暴露土壤栽培的黄瓜组织代谢途径变化进行了研究。代谢组学组学领域新方法和思路。上海代谢组学

尿液代谢组学研究案例，空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析，其中GC-MS检测102种代谢物，LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性，结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明，Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异，LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物，体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物，使用综合分析获得候选差异代谢物，其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物，确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物，包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明，***富集到5种代谢通路，与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。江苏代谢组学 数据分析空间代谢组学 代谢组学测序原理 代谢组学研究价格。

GC-MS代谢组学结果：通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物，其中，49种与数据库中可用的化合物相匹配，包括重要的发酵代谢物，如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量，表面（15 厘米）SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化，随着温度的升高，通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度（图 3）。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外，在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势（图 3）。此外，与植物应激反应相关的化合物（油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸）随温度升高而增加（SI 附录，图 S5）。

作者研究发现**酸过量会导致葡萄酒颜色变浅，但**酸干扰对酵母细胞繁殖和β-葡萄糖苷酶活性均无***影响，随后通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸干扰过程中葡萄酒代谢物的变化，发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢，通过加速其异构化来削弱花青素浓度，从而影响葡萄酒色泽，因而在葡萄酒生产中过程中应避免**酸过量。通过非靶代谢组学技术，能够了解发酵过程中，发酵液代谢物的变化情况。了解到在糖酵解过程中，多余的PA会扰乱糖酵解和三羧酸循环的过程，从而深入了解葡萄酒发酵过程中颜色变化的原因。上海鹿明生物科技有限公司多年来，一直专注于生命科学和生命技术领域，是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。目前鹿明生物在顶空代谢组学研究已经有了成熟的技术方法和多项项目经验。对生物体内所有代谢物进行定量分析-代谢组学。

代谢组学+转录组学研究：2022年2月，中国海洋大学食品科学与工程学院刘尊英教授课题组在《Foods》期刊发表的题为“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果，通过转录组学和代谢组学等研究方法，发现植物乳孢杆菌可以通过AI-2/luxs介导的群体感应(QS)系统来调节其生长特性和代谢，该系统是参与食品安全的正调控因子，这将有助于研究植物乳孢杆菌的生物保护控制潜力，特别是在食品工业生物技术中的应用。氨基酸代谢组学,胆汁酸代谢,脂肪酸代谢,神经递质代谢,花生四烯酸代谢。北京高分辨质谱代谢组学

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GC-MS非靶向代谢组：随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注，本篇为2020年2月，南京大学环境学院课题组在Environmental Science & Technology杂志（IF=9.028）发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组技术对土壤微生物组和代谢组学分析技术的独特结合，提供了对AgNPs生态影响的全新视角，***了解了AgNPs暴露对土壤微生物的影响。标题：银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊：EnvironmentalScience&Technology影响因子：9.028发表时间：2020年2月合作单位：南京大学环境学院运用生物技术：16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组（由鹿明生物提供技术支持）。上海代谢组学

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