上海代谢组学通路富集分析

LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例，中文标题：使用无偏差代谢组学方法鉴定短期暴露于颗粒物和微生物气溶胶中的青年人尿液生物标志物研究对象：年轻健康志愿者发表期刊：EnvironmentalPollution影响因子：8.071发表时间：2022年4月17日合作单位：中国医学科学院医药生物技术研究所卫计委***生物工程重点实验室、中国中医科学院广安门医院运用生物技术：LC-MS代谢组学、GC-MS代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法探索 92 名年轻健康个体的尿液代谢组学特征，并确定与短期共暴露相关的潜在生物标志物。代谢组学四大公司 代谢组学一般研究方法及步骤代谢组学分析流程。上海代谢组学通路富集分析

LC-MS非靶向代谢组学,中文标题：TNT、RDX、HMX（三种物）在苜蓿中的生物降解和植物毒性机制分析研究对象：苜蓿根发表期刊：Chemosphere影响因子：7.086发表时间：2021.05.18合作单位：西南科技大学运用关键技术：LC-MS非靶向代谢组学文章中LC-MS非靶向代谢组学由欧易/鹿明生物提供技术支持2021年5月，西南科技大学罗学刚教授团队在Chemosphere期刊发表的研究成果，通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法，探索了物暴露对植物的毒性机制，验证了植物体内被降解的TNT、RDX和HMX残留物和中间产物干扰植物正常生理代谢的假设。描绘了在三种物影响下苜蓿代谢组图谱，为环境污染物毒理学研究提供了新思路和方法。浙江代谢组学 液质联用常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。

尿液代谢组学研究案例，空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析，其中GC-MS检测102种代谢物，LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性，结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明，Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异，LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物，体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物，使用综合分析获得候选差异代谢物，其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物，确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物，包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明，***富集到5种代谢通路，与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。

GC-MS非靶向代谢组学研究，2022年2月，上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果，通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析，发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程，并对其在蛋白质组和代谢组水平上的分子机制有了新的认识。中文标题：氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色形成的重要过程发表期刊：FrontiersinMicrobiology影响因子：5.64作者单位：上海市农业科学院食用菌研究所涉及的欧易/鹿明生物服务产品：iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学。非靶向代谢组学 土壤非靶代谢学 非靶脂质组学研究。

代谢组学+转录组学，中文标题：基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象：斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊：JournalofHazardousMaterials影响因子：10.588运用生物技术：代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展，作者：杨桂玲，王彦华，李健，王豆，鲍志伟，王强（通讯作者），靳远详（共同通讯作者），在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章，通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。研究认为获得的数据可以为不同类型杀菌剂及其混合物对水生生物的毒性提供理论依据。代谢组学——研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。上海代谢组学研究

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代谢组学等多组学研究，2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文，通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*（iCCA）患者的配对**和*旁组织进行了分析，通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。上海代谢组学通路富集分析

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