2021年9月30日,国家自然科学基金委员会发布的《关于发布生命科学部2021年度指南引导类原创探索计划项目指南的通告》中,也表达了对于空间多维组学的资助支持。2021年11月推出的“鹿明空间代谢组千万医学支持计划(***期)”获得了许多科研工作者的关注及参与。现正式推出“鹿明空间代谢组千万医学支持计划(第二期)”。本次“鹿明空间代谢组千万医学支持计划(第二期)”采用的AFADESI空间代谢组平台,是基于中国医学科学院药物研究所再帕尔•阿不力孜教授与贺玖明教授团队经过十年精心打磨,自主研发成功的AFAI-MSI仪器平台。《鹿明生物空间代谢组学千万医学支持计划。浙江空间代谢组学研究意义
本研究应用空间代谢组学能够客观地识别食管腺*。EA组磷脂富含长链、多不饱和的PGs。并且,遗传学研究表明,这一机制与脂肪酸从头合成有关。这些结果表明,空间代谢组学可以区分恶性食管中的组织类型。在临床应用包括客观诊断和术中切缘评估具有潜在价值。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析。
贵州空间代谢组学和心脏鹿明生物是国内早期推出AFADESI-MSI空间代谢组技术服务的先导者。
AFADESI-MSI空间代谢组学:1、已落地执行项目100+,其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。高准性的定性算法通过物质表达空间情况、加和离子及同位素峰表达强度相似性、同位素表达空间分布相似性进行初步代谢物注释,并可基于专属物种组织类型数据库或非靶质谱数据基础上在初步注释结果基础上进一步获得更加准确定性的结果。已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。
空间代谢组学:前列腺*组织的分子表征对于寻找新的生物标志物、验证临床生物标志物和确定潜在的***靶点非常重要。然而,前列腺*组织样本包含正常上皮、增生、基质和**区域,具有高度异质性,组织间固有的功能和分子差异导致常规的批量检测方法有不同程度的信息丢失。质谱成像(MSI)可以对组织切片不同区域中的潜在**标志物进行空间检测,有利于分析和比较不同组织类型的代谢组和脂质组学特征。鹿明生物已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。空间分辨代谢组学进展和挑战。
空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构和生物分子信息的互补光谱模式的脂肪组谱的新证明。空间代谢组学基本研究流程。陕西空间代谢组学鹿明
蛋白质组学的研究方法。浙江空间代谢组学研究意义
收集了15名前列腺*患者共计45份新鲜冷冻组织**样本,进行空间代谢组学分析。从而实现对良性区域和**、NCE(包括正常腺体和增生)和**的不同组织类型的代谢组和脂质组学研究。样品和分析概述成功鉴定了 27 种代谢物和 44 种脂质,发现NCE(非*上皮细胞)、基质细胞和**组织代谢存在明显差异。欧易生物鹿明生物丰富的项目实战经验1、已落地执行项目100+,其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。浙江空间代谢组学研究意义
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