随着美国临床蛋白质组**分析项目(CPTAC)和中国人类蛋白质组计划(CNHPP)等大型蛋白质组学研究计划的推进,发表了一系列**的大规模人群多组学分析文章[2,3]。这些高分文章通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、代谢组学、微生物组学等技术,在上百例的病例样本中***表征了某种**的分子特征。对比这些文章,可以发现蛋白质组学数据在多组学数据分析中逐渐成为**结果,且蛋白质组学数据分析有些共同特点,即:1)基于蛋白质组进行**分子分型2)分析不同亚型患者的临床特征3)免疫、代谢、突变、微生物等**领域研究热点在不同亚型中的差别分析4)筛选亚型特征分子作为预后标志物或潜在的药靶...
单细胞蛋白组学研究方法:2020年9月,加州大学的MinnieM.Sarwal课题组在FrontiersinMedicine发表的题为“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果,通过单细胞蛋白组学研究方法,分析正常人近端肾小管和肾小球区域的肾脏细胞,研究为解开急性和慢性肾脏疾病病因和肾脏亚细胞功能扰动提供依据。中文标题:正常人肾脏近端肾小管和肾小球的单细胞蛋白质组学分析研究对象:人体肾脏组织发表期刊:FrontiersinMedicine影响因...
通过蛋白质组学+转录组学研究方法,发现大黄素引发外泌体通过抑制代谢通路来减少肺泡巨噬细胞的活化和改善肺部炎症的特征,探究了外泌体在参与炎症相关***损伤中的重要作用,为大黄素可以通过减少胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化来减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤提供依据。中文标题:大黄素通过抑制胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤研究对象:大鼠血浆外泌体发表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影响因子:11.413发表时间:2021年10月合作单位:四川大学华西医院运用生物技术:TMT标记定量蛋白组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)、转录组学蛋白质组学的...
蛋白组学技术是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。DIA作为一种新的质谱数据采集方式稳定性高,覆盖度广的优点。DIA蛋白组学技术已经越来越多的疾病研究中发挥重大作用。本研究通过DIA蛋白组学技术分析了8个SAPHO病人和8个健康人的蛋白表达谱。蛋白表达的相关性图显示组内相关性良好,差异蛋白的PCA图显示两组得到明显的区分。蛋白质组学通过研究生物样本中蛋白质组成和变化,从而推动疾病的病理机制研究,为临床诊断和预后提供潜在生物标志物。蛋白质组学多组学分析蛋白质组学研究进展。北京生信分析 蛋白组学蛋白组学技术可以提供细胞状态和调控的功能信息,本研究建立了单细胞蛋...
蛋白质是生命功能的直接体现者,近几年来,蛋白质组研究越来越多的体现在多种疾病机理的阐明,为科研问题攻克提供理论根据和解决途径。通过蛋白质组比较分析,找到特异性的蛋白,成为新药物设计的分子靶点,为疾病的早期诊断提供分子标志。然而生物体内的蛋白组学是一个非常复杂的体系。近几年来,由于质谱技术的发展,让我们对生物体内蛋白组的认识更加***和准确。尤其基于TimsTOF Pro系列质谱仪,被称为4D蛋白组学技术为蛋白组学提供全新的覆盖深度和通量,为精细医疗提供**技术支持力量。欧易生物、鹿明生物助力您的4D蛋白组学研究。单细胞蛋白组学之质谱流式细胞技术。上海蛋白组学代谢组学多少钱使用TMT标记定量蛋白...
label-free蛋白定量策略进行蛋白组学的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma,LUAD)是肺*的一种,属于非小细胞*,早期一般没有明显的临床症状,且易发生转移。肺腺*(LUAD)的基因组研究提高了对该**生物学的理解,加速了靶向***的进程。中国科学家选取了103例未经***的中国肺腺*患者的原位肺腺*组织及其相应的*旁组织(NAT)(样本策略),利用基于质谱的label-free蛋白定量策略进行蛋白组学的***分析。从多维度揭示疾病重要分子特征对蛋白质组、磷酸化蛋白质组、转录组和全外显子组测序数据的综合分析揭示了**相关特征,如**相关蛋白变异、特有的蛋白质组特征以...
DIA蛋白组学:SAPHO综合征是一种侵犯皮肤和骨骼的炎症性疾病,其发病率低,表现形式多样,诊断困难。2022年1月,由北京中医药大学课题组在J Proteomics.期刊发表的题为“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果,通过DIA蛋白组学研究方法,***揭示了SAPHO患者的血清蛋白质组谱,为疾病诊断提供了潜在的生物标志物。同时作者发现补体系统抑制剂如CFH和C4BP在SAPHO综合征中表达上调,这可能在SAPHO综合征的发病机制中发挥重要作用。蛋白质组学质...
DIA蛋白组学:SAPHO综合征是一种侵犯皮肤和骨骼的炎症性疾病,其发病率低,表现形式多样,诊断困难。2022年1月,由北京中医药大学课题组在J Proteomics.期刊发表的题为“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果,通过DIA蛋白组学研究方法,***揭示了SAPHO患者的血清蛋白质组谱,为疾病诊断提供了潜在的生物标志物。同时作者发现补体系统抑制剂如CFH和C4BP在SAPHO综合征中表达上调,这可能在SAPHO综合征的发病机制中发挥重要作用。欧易鹿明生物...
TMT标记定量蛋白质组学研究案例:2021年12月威尔康奈尔医学中心和纪念斯隆凯特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授课题组在Nature Communications期刊发表的题为 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通过蛋白质组学和代谢组学研究方法,发现了高度转移性 SOX2/OCT4+ 细胞的离散亚群表现出细胞内铜水平升高特征,探究了TM...
作者进行了综合分析,将蛋白组学和代谢组学中的***生物标志物合并到通路分析中,并确定了半乳糖代谢、戊糖和葡萄糖醛酸盐相互转化、柠檬酸盐循环和**酸代谢这几种途径。然后结合蛋白质和代谢标志物来预测DKD状态。五种机器学习模型表明,组合模型提高了DKD预测的准确性和稳定性。图中展示了RF的结果。总的来说,组合多组学标志物模型是一种强有力的提高DKD诊断的方法。1.蛋白组学结果表明,α2-巨球蛋白、组织蛋白酶D和CD324可作为检测DKD进展的潜在生物标志物。2.代谢组学结果表明,半乳糖代谢和甘油脂代谢是DKD的主要代谢途径,此外甘油-3-半乳糖苷可作为预测DKD的**标志物。3.蛋白组学和代谢组学...
随着质谱技术的飞速发展,特别是离子淌度的引入,增加了一个新的分离维度,将蛋白质组研究推进到全新的“4D蛋白质组”层面,打破了基于质谱的蛋白质组学研究的瓶颈,大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的***提升,可以更好的解决大队列、复杂体系以及微量样本的检测。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配备了***一代双TIMS分析器,离子容量可提高三倍。经过简化的离子透镜比较大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,为4D-多组学建立了新的标准。CCS 值的加入让组学结果更精细,也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具...
TMT蛋白质组学探究案例:2021年9月,安徽农业大学张照亮教授课题组在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊发表了题为“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果,通过TMT蛋白质组学和泛素化蛋白质组学研究方法,发现了氮缺乏条件下茶树根部响应的差异表达蛋白和泛素化蛋白质,为茶氨酸和黄酮类生物合成的调控提供了新的见解...