上海代谢组学和肠道菌群相关分析

GC-MS非靶向代谢组学yan'j2021年11月，上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果，通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，发现了BPF暴露的肠道毒性的特征，探究了可能的发病机理。

中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象：人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影响因子：7.963发表时间：2021年11月合作单位：上海交通大学附属新华医院运用生物技术：GC-MS非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组学、qRT-PCR 代谢组学专区 系统生物学驱动的功能代谢组学方法,具有高灵敏、高分辨和高通量。上海代谢组学和肠道菌群相关分析

GC-MS非靶向代谢组学研究：不同分子量聚乙烯颗粒改变了玉米根际土壤微生物群落组成和代谢谱AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究对象：聚乙烯颗粒、玉米、根际土壤发表期刊：JournalofHazardousMaterials影响因子：10.588组学技术：GC-MS非靶向代谢组学和16SrRNA测序(由欧易/鹿明生物提供技术支持)；这项研究的重点是确定不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。本文运用非靶向代谢组学，微生物16SrRNA测序等方法研究的结果证实，不同分子量的PE颗粒对土壤-植物系统有不利影响。不同分子量的PE颗粒在形状和表面微观结构上存在明显差异。土壤蔗糖酶和过氧化物酶对不同分子量的PE颗粒有***响应。江苏代谢组学概述上海 -代谢组学-提供高效检测分析服务。

本研究通过LC-MS和GC-MS双平台代谢组学研究方法，对92例样品5个时间点的尿液样品进行分析，分别找到了33种和155种与PM和生物气溶胶相关的差异标志物，结果揭示了年轻健康人在五个不同时间点的尿液代谢谱的动态变化，采用KEGG通路富集分析和时间序列分析确定了与短期共同暴露于空气中PM和生物气溶胶相关的几种潜在代谢物生物标志物，发现短期高浓度暴露于PM可能会导致代谢改变并降低应激***水平，这可能是与下丘脑-垂体-肾上腺和交感-肾上腺-髓质轴的***有关；而生物气溶胶剂则通过***系统对病理性成瘾有重要作用。其中尿液中的16-脱氢孕酮可能是PM暴露的潜在生物标志物；4-羟基苯乙醇可能是生物气溶胶的潜在生物标志物，可用于分别预测或诊断PM或生物气溶胶相关疾病。

非靶向代谢组学研究：2022年5月，欧易/鹿明生物合作客户甘肃省农业科学院程鸿团队和中国农业大学林涛团队在Frontiers in Plant Science期刊发表的题为 “Identification of Key Gene Networks Controlling Soluble Sugar and Organic Acid Metabolism During Oriental Melon Fruit Development by Integrated Analysis of Metabolic and Transcriptomic Analyses”的研究成果，采用非靶代谢组学和转录组研究方法，发现了蔗糖、D-葡萄糖、棉子糖的高积累以及相对较低的柠檬酸和苹果酸可能有助于东方甜瓜“甜宝”的甜味。代谢组学组学领域新方法和思路。

GC-MS代谢组学结果：通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物，其中，49种与数据库中可用的化合物相匹配，包括重要的发酵代谢物，如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量，表面（15 厘米）SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化，随着温度的升高，通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度（图 3）。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外，在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势（图 3）。此外，与植物应激反应相关的化合物（油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸）随温度升高而增加（SI 附录，图 S5）。代谢组学,代谢组数据库,代谢组分析,利用非靶检测寻找差异代谢物。上海代谢组学和肠道菌群相关分析

代谢组学-欧易生物/鹿明生物 客户好评 专注代谢组学研究。上海代谢组学和肠道菌群相关分析

代谢组学等多组学研究，2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文，通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*（iCCA）患者的配对**和*旁组织进行了分析，通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。上海代谢组学和肠道菌群相关分析

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