**靶向代谢组学研究,中文标题:代谢组学分析揭示了COVID-19新的发展特征研究对象:****患者发表期刊:EuropeanRespiratoryJournal影响因子:16.671发表时间:2021.7.21运用生物技术:LC-MS非靶代谢组学+靶向代谢组学,****已经***了1.6亿多人,并导致全世界数以百万的人死亡;至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以,识别****的潜在分子机制对于战胜**是至关重要的。此外,代谢物通过在疾病进展过程中获得***的病理生理学意义来反映个体的疾病进展。因此,中国广州多家研究机构的科研人员使用了非靶向和靶向代谢组学分析对****患者所有阶段血清的代谢...
GC-MS非靶向代谢组研究,随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注,本篇为2020年2月,南京大学赵丽娟课题组在Environmental Science & Technology杂志发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向...
非靶向代谢组学研究:对于代谢物分析,作者对非靶代谢组学测定,共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性(VIP)>1和p<0.05的筛选标准,在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物(DAM)(表1)。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段,发现S3的DAM比S1和S2更丰富,这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后,利用京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中,参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大,包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯...
微生物组和代谢组学结果表明,高比例的直链淀粉/支链淀粉比例能够调节消化和粘膜相关的盲肠微生物群落和代谢特征。三种比例中,喂养含有50%高直链淀粉的饮食具有更好的结果,因为其共生细菌(如Akkermansia,Lactobacillus和Faecalibacterium)的富集,戊酸盐的增加以及促炎细胞因子的减少。代谢组学结果显示盲肠组织的代谢特征发生了改变,包括脂质肉碱和α-生育酚等代谢物的上调和下调。这些发现为直链淀粉/支链淀粉的比例是如何通过调节微生物发酵,导致共生微生物群和代谢物的增殖,从而改善断奶山羊的盲肠环境提供了新的见解。本篇文章,检测了喂食不同直链淀粉/支链淀粉比例的山羊的盲肠中...
土壤代谢组学:银纳米颗粒(AgNPs)是使用*****的工程纳米材料之一,泄露可能导致颗粒在土壤中积累,并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响,但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征,但当前有关NPs暴露对土壤微生物群落影响的研究不包括对土壤代谢产物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改变的土壤微生物群相关信息,鉴于它们的已知功能,人们可以对土壤生物化学的变化提出合理假设。本文作者利用16S rRNA基因测序和非靶向代谢组学方法,研究了AgNPs对土壤微生物群落的长期影响。非靶标代谢组学预实...
代谢组学等多组学研究,2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文,通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*(iCCA)患者的配对**和*旁组织进行了分析,...
GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。代谢...
双平台代谢组学研究,2022年02月,中国中医科学院广安门医院李敏教授课题组在Biomedicine & Pharmacotherapy发表的题为 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果,发现了***通络方可有效地防治糖尿病并发症形成与发展,探究了***通络方防治糖尿病视网膜病变的作用机制,***通络方可改善糖尿病大鼠视网膜组织...
代谢组学+转录组学研究:2022年2月,中国海洋大学食品科学与工程学院刘尊英教授课题组在《Foods》期刊发表的题为“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通过转录组学和代谢组学等研究方法,发现植物乳孢杆菌可以通过AI-2/luxs介导的群体感应(QS)系统来调节其生长...
非靶向代谢组学研究:通过在三个成熟阶段收获两个东方甜瓜品种的果实作者使用非靶代谢组学联合转录组学发现可溶性糖和有机酸在转录组水平和代谢组水平的差异现象。这项研究运用多组学技术联合揭示了两个品种成熟过程中关键的代谢和转录特征。在本研究中,通过代谢和转录组分析的综合分析,研究了控制两个东方甜瓜品种'甜宝'和'小翠瓜'中糖和有机酸代谢的基因网络。筛选了与糖和有机酸代谢相关的关键代谢物和候选基因,并讨论了甜瓜品种甜度不同的可能解释。研究结果提高了对决定甜瓜发育和成熟过程中糖和有机酸积累和代谢的分子机制的理解。3分钟带你看懂代谢组学研究。浙江代谢组学做得好的公司GC-MS非靶向代谢组,标题:银纳米颗粒改...
土壤代谢组学:银纳米颗粒(AgNPs)是使用*****的工程纳米材料之一,泄露可能导致颗粒在土壤中积累,并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响,但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征,但当前有关NPs暴露对土壤微生物群落影响的研究不包括对土壤代谢产物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改变的土壤微生物群相关信息,鉴于它们的已知功能,人们可以对土壤生物化学的变化提出合理假设。本文作者利用16S rRNA基因测序和非靶向代谢组学方法,研究了AgNPs对土壤微生物群落的长期影响。代谢组学专区 系统...
非靶代谢组学、靶向代谢组学技术研究,2021年9月暨南大学白卫滨课题组在Food Chemistry发表了题为 “Pyruvic acid stress caused color attenuation by interfering with anthocyanins metabolism during alcoholic fermentation”的研究成果,通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸胁迫对葡萄酒品质的影响,发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢,从而影响葡萄酒色泽。中文标题:**酸胁迫通过干扰酒精发酵过程中的花青素代谢导致葡萄酒颜色变浅研究对象:葡萄、酵母菌发表...
非靶向代谢组学研究:对于代谢物分析,作者对非靶代谢组学测定,共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性(VIP)>1和p<0.05的筛选标准,在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物(DAM)(表1)。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段,发现S3的DAM比S1和S2更丰富,这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后,利用京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中,参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大,包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯...
LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例,中文标题:使用无偏差代谢组学方法鉴定短期暴露于颗粒物和微生物气溶胶中的青年人尿液生物标志物研究对象:年轻健康志愿者发表期刊:EnvironmentalPollution影响因子:8.071发表时间:2022年4月17日合作单位:中国医学科学院医药生物技术研究所卫计委***生物工程重点实验室、中国中医科学院广安门医院运用生物技术:LC-MS代谢组学、GC-MS代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法探索 92 名年轻健康个体的尿液代谢组学特征,并确定与短期共暴露相关的潜在生物标志物。代谢组学 生物...
粪便LC-MS代谢组学研究方法,2022年,复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科唐建国教授课题组在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊发表的题为“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通过粪便微生物16SrRNA测序和粪便LC-MS代谢组学研究方法,发现了DADS**...
土壤代谢组学:银纳米颗粒(AgNPs)是使用*****的工程纳米材料之一,泄露可能导致颗粒在土壤中积累,并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响,但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征,但当前有关NPs暴露对土壤微生物群落影响的研究不包括对土壤代谢产物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改变的土壤微生物群相关信息,鉴于它们的已知功能,人们可以对土壤生物化学的变化提出合理假设。本文作者利用16S rRNA基因测序和非靶向代谢组学方法,研究了AgNPs对土壤微生物群落的长期影响。代谢组学分析价格-...
GC-MS非靶向代谢组,标题:银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊:EnvironmentalScience&Technology影响因子:9.028发表时间:2020年2月合作单位:南京大学环境学院运用生物技术:16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)。银纳米颗粒(AgNPs)是使用*****的工程纳米材料之一,泄露可能导致颗粒在土壤中积累,并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响,但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征,但当前有关N...
GC-MS非靶向代谢组:随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注,本篇为2020年2月,南京大学环境学院课题组在Environmental Science & Technology杂志(IF=9.028)发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序...
通过转录组学和代谢组学(GC-MS非靶向代谢组学)对BPF暴露和对照组的细胞进行分析,筛选到差异的基因和代谢物。分别通过富集分析,找到差异基因或代谢物参与的条目或通路。***通过差异转录本、代谢物和促炎细胞因子的综合分析,揭露了它们之间的关系。本文通过多组学分析和体外模型的方式,发现了BPF暴露后肠上皮细胞转录组和代谢组谱的改变,揭露了BPF可能在肠道炎症发病机制的作用。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年1...
非靶代谢组学、靶向代谢组学技术研究,2021年9月暨南大学白卫滨课题组在Food Chemistry发表了题为 “Pyruvic acid stress caused color attenuation by interfering with anthocyanins metabolism during alcoholic fermentation”的研究成果,通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸胁迫对葡萄酒品质的影响,发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢,从而影响葡萄酒色泽。中文标题:**酸胁迫通过干扰酒精发酵过程中的花青素代谢导致葡萄酒颜色变浅研究对象:葡萄、酵母菌发表...
LC-MS靶向代谢组+16S微生物多样性检测研究。题目:粪便微生物可以区分酒精性肝炎引起的酒精摄入量,但不能区分疾病的严重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*样本类型:人粪便*检测平台:LC-MS靶向代谢组、16S微生物多样性检测为了表征酒精性肝炎有关的粪便微生物生态学,考察微生物组变化和疾病严重程度的关系,推断微生物生态学变化的功能相关性,本文作者将中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的粪便微生物组与健康(HC)和重度饮酒对照组(HDC)进行比较,通过16SrRNA基因测序鉴定微生物群分类,使用LC/MS平台测量粪便短链脂肪酸(SCFA)含量。重度饮酒患者与健康...
GC-MS非靶向代谢组学研究:不同分子量聚乙烯颗粒改变了玉米根际土壤微生物群落组成和代谢谱AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究对象:聚乙烯颗粒、玉米、根际土壤发表期刊:JournalofHazardousMaterials影响因子:10.588组学技术:GC-MS非靶向代谢组学和16SrRNA测序(由欧易/鹿明生物提供技术支持);这项研究的重点是确...
LC-MS非靶向代谢组学研究方法,2021年11月,宁波大学海洋科学学院王春琳团队在Frontiers in Marine Science期刊发表了题为“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,发现了氨基酸和能量代谢是参与青蟹适应盐度变化的主要因素,而脂质代谢物起辅助作用。中文标题:青蟹在适应盐度急剧下降过程中的代谢变化研究对象:青蟹发表期刊:FrontiersinMarineScience影响因子:4...
微生物16S rRNA测序+代谢组学研究:标题:EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠粪便、脑组织*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍(ASD)是一种发育障碍,目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明,肠道菌群与ASD发展之间存在联系,但肠道菌群与ASD的脑功能障碍(肠脑轴)联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因(位于7q号染色体,属于受体酪氨酸激酶Eph家族),因基因突变和在ASD患者中表达下调,被认为是AS...
GC-MS非靶向代谢组学等研究方法:2021年10月,广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖...
LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植(FMT)对血液代谢的影响。标题:藻酸盐寡糖化小鼠的微生物群成功减轻了小肠粘膜炎期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠小肠、肠道内容物、血浆*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、转录组、16S微生物多样性检测等本研究发现藻酸盐寡糖(AOS)可以减轻***药物白消安诱导的小肠细胞膜的损伤,特别是细胞连接和微绒毛;并有利于肠道菌群变化进而改善小肠功能,提高肠道的免疫功能。LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植(FMT)对血液代谢的影响,并分析了血液代谢物与肠道菌群之间的相关性,发现不同剂量的粪便移植对血液代谢组均产生了***影响,...
尿液代谢组学研究案例,空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析,其中GC-MS检测102种代谢物,LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性,结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明,Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异,LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物,体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物,使用综合分析获得候选差异代谢物,其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短...
粪便代谢组分析,中文标题:二烯丙基二硫化物(DADS)通过调节肠道微生物群和代谢物来保护小鼠肠道及改善白色念珠菌***研究对象:小鼠粪便发表期刊:FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影响因子:5.293发表时间:2022年1月7日合作单位:复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科运用生物技术:粪便代谢组分析(由鹿明生物提供技术支持)、微生物16SrRNA测序。文章通过建立DSS 诱导的肠道白色念珠菌小鼠模型,模拟人类肠道******。一方面证实了白色念珠菌可以增强 DSS 结肠炎的严重程度,另一方面通过微生物组学和代谢组学等手段确认了 DA...
GC-MS非靶向代谢组,标题:银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊:EnvironmentalScience&Technology影响因子:9.028发表时间:2020年2月合作单位:南京大学环境学院运用生物技术:16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)。银纳米颗粒(AgNPs)是使用*****的工程纳米材料之一,泄露可能导致颗粒在土壤中积累,并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响,但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征,但当前有关N...
非靶向和靶向代谢组学研究方法,2021年7月,广州多家研究机构科研人员在EuropeanRespiratoryJournal期刊发表了题为“Metabolomicanalysesrevealsnewstage-specificfeaturesoftheCOVID-19”的研究成果,该研究以****患者为研究对象,运用非靶向和靶向代谢组学研究方法,提供了****患者所有阶段循环代谢物特征的综合视图,并确定糖代谢和尿素循环的代谢重新编程是****的潜在病理机制;提出以宿主代谢为靶点可能是在病程不同阶段对抗****的一种可行的方法。氨基酸代谢组学,胆汁酸代谢,脂肪酸代谢,神经递质代谢,花生四烯酸代谢...