粪便代谢组分析，中文标题：二烯丙基二硫化物(DADS)通过调节肠道微生物群和代谢物来保护小鼠肠道及改善白色念珠菌***研究对象：小鼠粪便发表期刊：FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影响因子：5.293发表时间：2022年1月7日合作单位：复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科运用生物技术：粪便代谢组分析（由鹿明生物提供技术支持）、微生物16SrRNA测序。文章通过建立DSS 诱导的肠道白色念珠菌小鼠模型，模拟人类肠道******。一方面证实了白色念珠菌可以增强 DSS 结肠炎的严重程度，另一方面通过微生物组学和代谢组学等手段确认了 DA...

土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化，使用基于GC-MS的非靶向代谢组学，在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量，定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5，在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物（图3I），除少数几个代谢物上调，大多数代谢物减少，表明AgNPs暴露通常会对土壤微生物的代谢产生负面影响。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应，包括毒性机制和***策略。代谢组学——研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。北京质代谢组学GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究：盐...

GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，2021年11月，上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果，通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，发现了BPF暴露的肠道毒性的特征，探究了可能的发病机理。中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(...

粪便LC-MS代谢组学研究方法，2022年，复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科唐建国教授课题组在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊发表的题为“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果，通过粪便微生物16SrRNA测序和粪便LC-MS代谢组学研究方法，发现了DADS**...

微生物16S rRNA测序+代谢组学研究：标题：EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊：MicrobiomeIF=14.650研究思路：*样本类型：小鼠粪便、脑组织*检测平台：LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍（ASD）是一种发育障碍，目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明，肠道菌群与ASD发展之间存在联系，但肠道菌群与ASD的脑功能障碍（肠脑轴）联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因（位于7q号染色体，属于受体酪氨酸激酶Eph家族），因基因突变和在ASD患者中表达下调，被认为是AS...

GC-MS非靶向代谢组，标题：银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊：EnvironmentalScience&Technology影响因子：9.028发表时间：2020年2月合作单位：南京大学环境学院运用生物技术：16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组（由鹿明生物提供技术支持）。银纳米颗粒（AgNPs）是使用*****的工程纳米材料之一，泄露可能导致颗粒在土壤中积累，并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响，但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征，但当前有关N...

代谢组学研究：浓香型白酒（SFB）在窖泥窖内发酵过程中，获得了其特有的风味。窖泥中的微生物是产生风味酯的关键前提物。本篇为欧易/鹿明生物合作客户四川省农业科学院水稻高粱研究所（一作：刘茂柯）于2020年3月在微生物学专刊《mSystems》（IF=6.469）发表的题为“Structural and Functional Changes in Prokaryotic Communities in Artificial Pit Mud during Chinese Baijiu Production”的研究报道，该研究对酿造微生态系统进行了***16S rRNA测序，蛋白质组学和代谢组学联合分析...

顶空GC-MS代谢组学，中文标题：利用BADH2新等位基因生产芳香三系杂交稻研究对象：水稻发表期刊：PlantBiotechnologyJournal影响因子：9.803发表时间：2021.08.31发表单位：中国水稻研究所运用生物技术：GC-MS顶空代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、基因编辑技术香味是决定稻米烹饪和食用特性的独特和关键指标之一。2021年8月，中国水稻研究所胡培松院士团队在PlantBiotechnologyJournal期刊发表的研究成果，依靠GC-MS顶空代谢组学的平台对BADH2等位基因系成熟籽粒进行性状分析。研究新型BADH2等位基因生产芳香杂交水稻机理，加快了水稻...

有机酸靶向代谢组学研究：中文标题：通过代谢和转录组分析的综合分析鉴定控制东方甜瓜果实发育过程中可溶性糖和有机酸代谢的关键基因网络研究对象：甜瓜发表期刊：Front.PlantSci.影响因子：5.753发表时间：2022年5月12日合作单位:甘肃省农业科学院蔬菜研究所，中国农业大学园艺学院运用生物技术：非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组学（由欧易生物提供技术支持）在本研究中，通过***的转录组分析和代谢物分析，作者发现东方甜瓜品种'甜宝'（A）的果实含糖量高，'小翠瓜'（B）的果实含糖量低，并同时在不同的发展阶段进行了比较。研究有助于阐明与甜瓜中糖和有机酸代谢相关的基因的动态和差...

GC-MS非靶向代谢组：随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注，本篇为2020年2月，南京大学环境学院课题组在Environmental Science & Technology杂志（IF=9.028）发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序...

非靶向代谢组学研究：2022年5月，欧易/鹿明生物合作客户甘肃省农业科学院程鸿团队和中国农业大学林涛团队在Frontiers in Plant Science期刊发表的题为 “Identification of Key Gene Networks Controlling Soluble Sugar and Organic Acid Metabolism During Oriental Melon Fruit Development by Integrated Analysis of Metabolic and Transcriptomic Analyses”的研究成果，采用非靶代谢组学和转录组...

土壤代谢组学：银纳米颗粒（AgNPs）是使用*****的工程纳米材料之一，泄露可能导致颗粒在土壤中积累，并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响，但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征，但当前有关NPs暴露对土壤微生物群落影响的研究不包括对土壤代谢产物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改变的土壤微生物群相关信息，鉴于它们的已知功能，人们可以对土壤生物化学的变化提出合理假设。本文作者利用16S rRNA基因测序和非靶向代谢组学方法，研究了AgNPs对土壤微生物群落的长期影响。靶向代谢组学、非靶...

代谢组学研究：浓香型白酒（SFB）在窖泥窖内发酵过程中，获得了其特有的风味。窖泥中的微生物是产生风味酯的关键前提物。本篇为欧易/鹿明生物合作客户四川省农业科学院水稻高粱研究所（一作：刘茂柯）于2020年3月在微生物学专刊《mSystems》（IF=6.469）发表的题为“Structural and Functional Changes in Prokaryotic Communities in Artificial Pit Mud during Chinese Baijiu Production”的研究报道，该研究对酿造微生态系统进行了***16S rRNA测序，蛋白质组学和代谢组学联合分析...

GC-MS非靶向代谢组学研究：不同分子量聚乙烯颗粒改变了玉米根际土壤微生物群落组成和代谢谱AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究对象：聚乙烯颗粒、玉米、根际土壤发表期刊：JournalofHazardousMaterials影响因子：10.588组学技术：GC-MS非靶向代谢组学和16SrRNA测序(由欧易/鹿明生物提供技术支持)；这项研究的重点是确...

有机酸靶向代谢组学研究：中文标题：通过代谢和转录组分析的综合分析鉴定控制东方甜瓜果实发育过程中可溶性糖和有机酸代谢的关键基因网络研究对象：甜瓜发表期刊：Front.PlantSci.影响因子：5.753发表时间：2022年5月12日合作单位:甘肃省农业科学院蔬菜研究所，中国农业大学园艺学院运用生物技术：非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组学（由欧易生物提供技术支持）在本研究中，通过***的转录组分析和代谢物分析，作者发现东方甜瓜品种'甜宝'（A）的果实含糖量高，'小翠瓜'（B）的果实含糖量低，并同时在不同的发展阶段进行了比较。研究有助于阐明与甜瓜中糖和有机酸代谢相关的基因的动态和差...

GC-MS非靶向代谢组学yan'j2021年11月，上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果，通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，发现了BPF暴露的肠道毒性的特征，探究了可能的发病机理。 中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F...

非靶向代谢组学研究：2022年5月，欧易/鹿明生物合作客户甘肃省农业科学院程鸿团队和中国农业大学林涛团队在Frontiers in Plant Science期刊发表的题为 “Identification of Key Gene Networks Controlling Soluble Sugar and Organic Acid Metabolism During Oriental Melon Fruit Development by Integrated Analysis of Metabolic and Transcriptomic Analyses”的研究成果，采用非靶代谢组学和转录组...

通过转录组学和代谢组学（GC-MS非靶向代谢组学）对BPF暴露和对照组的细胞进行分析，筛选到差异的基因和代谢物。分别通过富集分析，找到差异基因或代谢物参与的条目或通路。***通过差异转录本、代谢物和促炎细胞因子的综合分析，揭露了它们之间的关系。本文通过多组学分析和体外模型的方式，发现了BPF暴露后肠上皮细胞转录组和代谢组谱的改变，揭露了BPF可能在肠道炎症发病机制的作用。中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象：人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影响因子：7.963发表时间：2021年1...

GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，2021年11月，上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果，通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法，发现了BPF暴露的肠道毒性的特征，探究了可能的发病机理。中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(...

非靶向代谢组学研究：对于代谢物分析，作者对非靶代谢组学测定，共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性（VIP）>1和p<0.05的筛选标准，在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物（DAM）（表1）。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段，发现S3的DAM比S1和S2更丰富，这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后，利用京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中，参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大，包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯...

GC-MS非靶向代谢组学研究，中文标题：代谢组学分析和氧化应激反应揭示了有机磷类阻燃剂磷酸三(2-氯乙基)和磷酸三苯基对大肠杆菌的毒性研究对象：大肠杆菌发表期刊：Chemosphere影响因子：7.086作者单位：广东石油化工大学环境科学与工程学院涉及的欧易/鹿明生物服务产品：GC-MS非靶向代谢组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)以往有关呕吐***的研究多集中在免疫毒性、神经毒性、生殖毒性、遗传毒性等方面，而关于生长发育影响的研究较少。该研究是一篇通过大肠杆菌作为研究对象利用非靶向代谢组学来探究有机磷阻燃剂影响生物的发育和功能的高质量的、创新性的的研究文章，值得学习与借鉴。代谢组学暨多元变量...

LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例，中文标题：***通络***通过***和抗氧化作用预防及延缓糖尿病视网膜病变发展的机制研究研究对象：大鼠发表期刊：Biomedicine&Pharmacotherapy影响因子：6.529发表时间：2022年2月合作单位：中国中医科学院广安门医院运用生物技术：LC-MS+GC-MS双平台代谢组学（由鹿明生物提供技术支持)。文章通过对中药***—***通络方改善糖尿病病理方面的深入研究，表明在预防及***方面和微观层面均起到了***效果。同时，也探究出***通络方的内在作用机制。也为糖尿病视网膜病变的早期***，提供***、有效的***方法。其中LC-...

代谢组学研究：浓香型白酒（SFB）在窖泥窖内发酵过程中，获得了其特有的风味。窖泥中的微生物是产生风味酯的关键前提物。本篇为欧易/鹿明生物合作客户四川省农业科学院水稻高粱研究所（一作：刘茂柯）于2020年3月在微生物学专刊《mSystems》（IF=6.469）发表的题为“Structural and Functional Changes in Prokaryotic Communities in Artificial Pit Mud during Chinese Baijiu Production”的研究报道，该研究对酿造微生态系统进行了***16S rRNA测序，蛋白质组学和代谢组学联合分析...

双平台代谢组学研究，2022年02月，中国中医科学院广安门医院李敏教授课题组在Biomedicine & Pharmacotherapy发表的题为 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果，发现了***通络方可有效地防治糖尿病并发症形成与发展，探究了***通络方防治糖尿病视网膜病变的作用机制，***通络方可改善糖尿病大鼠视网膜组织...

GC-MS非靶向代谢组学等研究方法：2021年10月，广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果，通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法，发现包括糖酵解/糖...

微生物16S rRNA测序+代谢组学研究：标题：EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊：MicrobiomeIF=14.650研究思路：*样本类型：小鼠粪便、脑组织*检测平台：LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍（ASD）是一种发育障碍，目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明，肠道菌群与ASD发展之间存在联系，但肠道菌群与ASD的脑功能障碍（肠脑轴）联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因（位于7q号染色体，属于受体酪氨酸激酶Eph家族），因基因突变和在ASD患者中表达下调，被认为是AS...

双平台代谢组学研究，2022年02月，中国中医科学院广安门医院李敏教授课题组在Biomedicine & Pharmacotherapy发表的题为 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果，发现了***通络方可有效地防治糖尿病并发症形成与发展，探究了***通络方防治糖尿病视网膜病变的作用机制，***通络方可改善糖尿病大鼠视网膜组织...

代谢组学+转录组学研究：2022年2月，中国海洋大学食品科学与工程学院刘尊英教授课题组在《Foods》期刊发表的题为“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果，通过转录组学和代谢组学等研究方法，发现植物乳孢杆菌可以通过AI-2/luxs介导的群体感应(QS)系统来调节其生长...

代谢组学+转录组学，中文标题：基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象：斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊：JournalofHazardousMaterials影响因子：10.588运用生物技术：代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展，作者：杨桂玲，王彦华，李健，王豆，鲍志伟，王强（通讯作者），靳远详（共同通讯作者），在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章，通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发...

GC-MS非靶向代谢组学研究，2022年2月，上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果，通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析，发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程，并对其在蛋白质...