有机酸靶向代谢组学研究:中文标题:通过代谢和转录组分析的综合分析鉴定控制东方甜瓜果实发育过程中可溶性糖和有机酸代谢的关键基因网络研究对象:甜瓜发表期刊:Front.PlantSci.影响因子:5.753发表时间:2022年5月12日合作单位:甘肃省农业科学院蔬菜研究所,中国农业大学园艺学院运用生物技术:非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学(由欧易生物提供技术支持)在本研究中,通过***的转录组分析和代谢物分析,作者发现东方甜瓜品种'甜宝'(A)的果实含糖量高,'小翠瓜'(B)的果实含糖量低,并同时在不同的发展阶段进行了比较。研究有助于阐明与甜瓜中糖和有机酸代谢相关的基因的动态和差...
非靶向代谢组学研究:利用番茄的自然变异确定番茄复合体中果实多酚的途径结构和代谢调控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究对象:番茄组织发表期刊:MolecularPlant影响因子:13.164组学技术:LC-MS靶向代谢组学、GC-MS非靶代谢组(双平台代谢组学),本研究通过表征构成八种不同番茄多酚代谢网络的潜在生物合成和修饰反应,阐明了八种番茄复合体多酚生物合成的整个生物合成框架...
代谢组学数据提供了COVID-19患者各阶段循环代谢物特征的综合观点,并确定了葡萄糖代谢和尿素循环的代谢重编程是COVID-19的潜在病理机制。在****病程的不同阶段,靶向宿主代谢可能是一种可行的方法。非靶向代谢组学分析中,发现队列中的样品共鉴定出2466个代谢物峰,负离子模式631个、正离子模式下的1835个;通过筛选,鉴定出240种代谢物。轻症组的代谢物与正常组部分重合,而重症组和恢复组很容易区分(图1B)。240个代谢物中有193个与COVID-19***相关(图1C)。火山图显示了不同组代谢物与正常组相比上调下调的情况(图1D);与正常组对比,***上调的代谢物:轻症组有48个,严重...
代谢组学+转录组学研究:2022年2月,中国海洋大学食品科学与工程学院刘尊英教授课题组在《Foods》期刊发表的题为“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通过转录组学和代谢组学等研究方法,发现植物乳孢杆菌可以通过AI-2/luxs介导的群体感应(QS)系统来调节其生长...
高通量代谢组学研究,中文标题:高通量代谢组学方法发现***羊藿提取物对骨质疏松症影响的代谢生物标志物及途径发表期刊:Frontiersinpharmacology影响因子:5.810发表时间:2020年8月发表单位:南昌大学***附属医院运用组学技术:超高效液相色谱法结合四极杆飞行时间质谱法技术(UPLC-Q-TOF/MS)代谢组学。本研究采用UPLC-Q-TOF/MS代谢组学对OP模型中的大鼠和不同剂量Ext-epi处理的大鼠进行分析,从大鼠血清代谢组学和标志物相关代谢途径中揭示了46种潜在生物。不同剂量组的Ext-epi对16种潜在的生物标志物具有***的逆转作用,涉及三种主要的代谢途径,...
作者研究发现**酸过量会导致葡萄酒颜色变浅,但**酸干扰对酵母细胞繁殖和β-葡萄糖苷酶活性均无***影响,随后通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸干扰过程中葡萄酒代谢物的变化,发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢,通过加速其异构化来削弱花青素浓度,从而影响葡萄酒色泽,因而在葡萄酒生产中过程中应避免**酸过量。通过非靶代谢组学技术,能够了解发酵过程中,发酵液代谢物的变化情况。了解到在糖酵解过程中,多余的PA会扰乱糖酵解和三羧酸循环的过程,从而深入了解葡萄酒发酵过程中颜色变化的原因。上海鹿明生物科技有限公司多年来,一直专注于生命科学和生命技术领域,是国内早期开展以蛋白组和代谢组...
代谢组学等多组学研究,2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文,通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*(iCCA)患者的配对**和*旁组织进行了分析,...
GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。欧易...
GC-MS非靶向代谢组学研究,中文标题:代谢组学分析和氧化应激反应揭示了有机磷类阻燃剂磷酸三(2-氯乙基)和磷酸三苯基对大肠杆菌的毒性研究对象:大肠杆菌发表期刊:Chemosphere影响因子:7.086作者单位:广东石油化工大学环境科学与工程学院涉及的欧易/鹿明生物服务产品:GC-MS非靶向代谢组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)以往有关呕吐***的研究多集中在免疫毒性、神经毒性、生殖毒性、遗传毒性等方面,而关于生长发育影响的研究较少。该研究是一篇通过大肠杆菌作为研究对象利用非靶向代谢组学来探究有机磷阻燃剂影响生物的发育和功能的高质量的、创新性的的研究文章,值得学习与借鉴。代谢组学-鹿明生物...
GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究:盐度的变化会影响甲壳类动物的生长、***和疾病状态。文章作者通过非靶代谢组学对青蟹适应盐度急性下降过程中的代谢变化进行了研究,利用GC-MS和LC-MS数据联合分析了青蟹应对盐度急性下降情况的主要代谢途径。研究结果表明,在急性低盐胁迫下,青蟹通过甘油磷脂代谢物调节生物膜的结构发生变化,然后通过ABCs转运蛋白运输氨基酸和碳水化合物,实现细胞内外的渗透平衡。此项研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。王春琳课题组深耕青蟹研究,近些年来探索青蟹对环境的适应变化也在各大期刊上发表:项目文章|iTRAQ蛋白组学助力宁波大学越冬期间拟穴青蟹代谢变化研究项目...
**靶向代谢组学研究,中文标题:代谢组学分析揭示了COVID-19新的发展特征研究对象:****患者发表期刊:EuropeanRespiratoryJournal影响因子:16.671发表时间:2021.7.21运用生物技术:LC-MS非靶代谢组学+靶向代谢组学,****已经***了1.6亿多人,并导致全世界数以百万的人死亡;至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以,识别****的潜在分子机制对于战胜**是至关重要的。此外,代谢物通过在疾病进展过程中获得***的病理生理学意义来反映个体的疾病进展。因此,中国广州多家研究机构的科研人员使用了非靶向和靶向代谢组学分析对****患者所有阶段血清的代谢...
尿液代谢组学研究案例,空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析,其中GC-MS检测102种代谢物,LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性,结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明,Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异,LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物,体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物,使用综合分析获得候选差异代谢物,其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短...
代谢组学+转录组学,中文标题:基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象:斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊:JournalofHazardousMaterials影响因子:10.588运用生物技术:代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发...
非靶向代谢组学研究:利用番茄的自然变异确定番茄复合体中果实多酚的途径结构和代谢调控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究对象:番茄组织发表期刊:MolecularPlant影响因子:13.164组学技术:LC-MS靶向代谢组学、GC-MS非靶代谢组(双平台代谢组学),本研究通过表征构成八种不同番茄多酚代谢网络的潜在生物合成和修饰反应,阐明了八种番茄复合体多酚生物合成的整个生物合成框架...
LC-MS靶向代谢组学研究本篇文章通过LC-MS靶向代谢组学和16S rRNA基因序列分析,探究谷物在加工传统饮料ogi过程中******的减少和细菌群落的动态变化。同时,从粮食安全方面考虑,谷物的污染水平低、较安全,又优于玉米,可以代替受******污染的玉米品种。欧易/鹿明生物推出的16s+代谢组学的多层组学研究思路继本篇文章前已先后助力了浙江工业大学、中国农科院、青岛农业大学等在微生物一区顶刊Microbiome、医学一区顶刊GUT发表文章。项目文章PBP | 浙江工业大学傅正伟运用GC-MS非靶向代谢组学和16S探究水稻根际微生物群落影响项目文章 | 恭喜中国农科院及青岛农业大学团队继...
双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中国医学科学院医药生物技术研究所李亮课题组在Environmental Pollution期刊发表了题为“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通过LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法,发现了空气中颗粒物和生物气溶胶暴露有关的尿液生物标志物,并揭示了...
非靶代谢组学、靶向代谢组学技术研究,2021年9月暨南大学白卫滨课题组在Food Chemistry发表了题为 “Pyruvic acid stress caused color attenuation by interfering with anthocyanins metabolism during alcoholic fermentation”的研究成果,通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸胁迫对葡萄酒品质的影响,发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢,从而影响葡萄酒色泽。中文标题:**酸胁迫通过干扰酒精发酵过程中的花青素代谢导致葡萄酒颜色变浅研究对象:葡萄、酵母菌发表...
非靶向代谢组学研究:通过在三个成熟阶段收获两个东方甜瓜品种的果实作者使用非靶代谢组学联合转录组学发现可溶性糖和有机酸在转录组水平和代谢组水平的差异现象。这项研究运用多组学技术联合揭示了两个品种成熟过程中关键的代谢和转录特征。在本研究中,通过代谢和转录组分析的综合分析,研究了控制两个东方甜瓜品种'甜宝'和'小翠瓜'中糖和有机酸代谢的基因网络。筛选了与糖和有机酸代谢相关的关键代谢物和候选基因,并讨论了甜瓜品种甜度不同的可能解释。研究结果提高了对决定甜瓜发育和成熟过程中糖和有机酸积累和代谢的分子机制的理解。非靶标代谢组学预实验,周期短,报告快,专业可信耐。上海代谢组学**顶空GC-MS代谢组学,中文...
代谢组学+转录组学,中文标题:基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象:斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊:JournalofHazardousMaterials影响因子:10.588运用生物技术:代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发...
双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中国医学科学院医药生物技术研究所李亮课题组在Environmental Pollution期刊发表了题为“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通过LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法,发现了空气中颗粒物和生物气溶胶暴露有关的尿液生物标志物,并揭示了...
非靶向代谢组学研究:2022年5月,欧易/鹿明生物合作客户甘肃省农业科学院程鸿团队和中国农业大学林涛团队在Frontiers in Plant Science期刊发表的题为 “Identification of Key Gene Networks Controlling Soluble Sugar and Organic Acid Metabolism During Oriental Melon Fruit Development by Integrated Analysis of Metabolic and Transcriptomic Analyses”的研究成果,采用非靶代谢组学和转录组...
土壤代谢组学:银纳米颗粒(AgNPs)是使用*****的工程纳米材料之一,泄露可能导致颗粒在土壤中积累,并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响,但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征,但当前有关NPs暴露对土壤微生物群落影响的研究不包括对土壤代谢产物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改变的土壤微生物群相关信息,鉴于它们的已知功能,人们可以对土壤生物化学的变化提出合理假设。本文作者利用16S rRNA基因测序和非靶向代谢组学方法,研究了AgNPs对土壤微生物群落的长期影响。非靶向代谢组学 土...
LC-MS非靶向代谢组学,中文标题:TNT、RDX、HMX(三种物)在苜蓿中的生物降解和植物毒性机制分析研究对象:苜蓿根发表期刊:Chemosphere影响因子:7.086发表时间:2021.05.18合作单位:西南科技大学运用关键技术:LC-MS非靶向代谢组学文章中LC-MS非靶向代谢组学由欧易/鹿明生物提供技术支持2021年5月,西南科技大学罗学刚教授团队在Chemosphere期刊发表的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,探索了物暴露对植物的毒性机制,验证了植物体内被降解的TNT、RDX和HMX残留物和中间产物干扰植物正常生理代谢的假设。描绘了在三种物影响下苜蓿代谢组图谱,为...
LC-MS非靶向代谢组学,中文标题:TNT、RDX、HMX(三种物)在苜蓿中的生物降解和植物毒性机制分析研究对象:苜蓿根发表期刊:Chemosphere影响因子:7.086发表时间:2021.05.18合作单位:西南科技大学运用关键技术:LC-MS非靶向代谢组学文章中LC-MS非靶向代谢组学由欧易/鹿明生物提供技术支持2021年5月,西南科技大学罗学刚教授团队在Chemosphere期刊发表的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,探索了物暴露对植物的毒性机制,验证了植物体内被降解的TNT、RDX和HMX残留物和中间产物干扰植物正常生理代谢的假设。描绘了在三种物影响下苜蓿代谢组图谱,为...
粪便LC-MS代谢组学研究方法,2022年,复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科唐建国教授课题组在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊发表的题为“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通过粪便微生物16SrRNA测序和粪便LC-MS代谢组学研究方法,发现了DADS**...
GC-MS非靶向代谢组学研究,2022年2月,上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析,发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程,并对其在蛋白质...
非靶向代谢组学研究:通过在三个成熟阶段收获两个东方甜瓜品种的果实作者使用非靶代谢组学联合转录组学发现可溶性糖和有机酸在转录组水平和代谢组水平的差异现象。这项研究运用多组学技术联合揭示了两个品种成熟过程中关键的代谢和转录特征。在本研究中,通过代谢和转录组分析的综合分析,研究了控制两个东方甜瓜品种'甜宝'和'小翠瓜'中糖和有机酸代谢的基因网络。筛选了与糖和有机酸代谢相关的关键代谢物和候选基因,并讨论了甜瓜品种甜度不同的可能解释。研究结果提高了对决定甜瓜发育和成熟过程中糖和有机酸积累和代谢的分子机制的理解。代谢组学专业第三方检测,出具报告快,数据准。北京代谢组学公司GC-MS代谢组学结果:通过GC-...
尿液代谢组学研究案例,空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析,其中GC-MS检测102种代谢物,LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性,结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明,Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异,LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物,体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物,使用综合分析获得候选差异代谢物,其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短...
代谢组学数据提供了COVID-19患者各阶段循环代谢物特征的综合观点,并确定了葡萄糖代谢和尿素循环的代谢重编程是COVID-19的潜在病理机制。在****病程的不同阶段,靶向宿主代谢可能是一种可行的方法。非靶向代谢组学分析中,发现队列中的样品共鉴定出2466个代谢物峰,负离子模式631个、正离子模式下的1835个;通过筛选,鉴定出240种代谢物。轻症组的代谢物与正常组部分重合,而重症组和恢复组很容易区分(图1B)。240个代谢物中有193个与COVID-19***相关(图1C)。火山图显示了不同组代谢物与正常组相比上调下调的情况(图1D);与正常组对比,***上调的代谢物:轻症组有48个,严重...
GC-MS非靶向代谢组:随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注,本篇为2020年2月,南京大学环境学院课题组在Environmental Science & Technology杂志(IF=9.028)发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序...